Coronavirus

Orthocoronavirinae

Orthocoronavirinae Beschreibung dieses Bildes, auch unten kommentiert Virionen von SARS-CoV . Einstufung
Typ Virus
Domain Riboviria
Regieren Orthornaviren
Zweig Pisuviricota
Klasse Pisoniviricetes
Befehl Nidoviren
Unterordnung Cornidovirineae
Familie Coronaviridae

Unterfamilie

ICTV Orthocoronavirinae

Genres mit niedrigerem Rang

Das Coronavirus ( CoV ) sind Viren , die die Unterfamilie Orthocoronavirinae der Familie Coronaviridae bilden . Der Name "Coronavirus", aus dem Lateinischen "Kronenvirus", ist auf das Auftreten von Virionen unter einem Elektronenmikroskop zurückzuführen , mit einem Rand großer bauchiger Vorsprünge, die einer Sonnenkorona ähneln .

Coronaviren haben eine Virushülle mit einem Kapsid, das durch keulenförmige Proteine ​​(so genannte Spiculae ) gekennzeichnet ist. Sie haben ein Genom auf RNA - Einzelstrang (die einen einzelnen Strang zu sagen ist), zu Sinne positiv (Gruppe IV der Baltimore Klassifizierung ), 26 bis 32 Kilobasen (es die größten Genome unter Herstellung von Virus - RNA ). Sie werden in die Nidovirales eingeordnet , eine Ordnung von Viren, die bei einer Infektion einen verschachtelten Satz subgenomischer mRNAs produzieren . Von Spikulen , einer Hülle , Kapsidmembran und tragen zum Gesamtaufbau aller Coronaviren bei. Sie können mutieren und rekombinieren.

Die Fledermäuse und Vögel , wie Wirbeltiere fliegen heißes Blut , würden die seinen Gast ideal für corona der Entwicklung und Verbreitung der corona führt. Coronaviren sind je nach Art normalerweise spezifisch für ein Tiertaxon als Wirt, Säugetier oder Vogel; aber sie können manchmal als Folge einer Mutation den Wirt wechseln . Ihre Mensch-zu-Mensch - Übertragung erfolgt hauptsächlich durch den engen Kontakt über respiratorische Aerosole erzeugt durch Niesen, Husten oder telefonieren. Bei Fledermäusen wurden mehr als 500 Coronavirus-Typen isoliert, und es gibt mehr als 5.000 Coronavirus-Typen.

Sieben Haupt-Coronaviren werden allgemein als in der Lage, Menschen zu infizieren, genannt . Ein achtes wurde identifiziert: B814 (das erste identifizierte menschliche Coronavirus), aber dieser Stamm scheint nicht mehr im Umlauf zu sein.

Vier zirkulierende Coronaviren gelten als gutartige Infektionsquellen: 229E , NL63 , OC43 und HKU1 . Sie sind die Ursache für 15 bis 30 % der Erkältungskrankheiten.

In jüngerer Zeit wurden drei Arten von Coronavirus identifiziert, die für eine schwere Lungenentzündung verantwortlich sind  :

  1. das SARS-CoV , Erreger von Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) 2002-2004
  2. das MERS-CoV , das von Respiratory Syndrome Middle East aus dem Jahr 2012
  3. die SARS-CoV-2 , das von Krankheit corona 2019 (Covid-19) erschien in China in 2019 und verantwortlich für eine schwere Pandemie in 2020-2021

Entdeckung, Geschichte

Die corona wahrscheinlich mindestens Hunderte von Millionen von Jahren, aber aus der Sicht der Epidemiologie und medizinischer Geschichte, und als Zoonose ist die XXI ten  Jahrhundert sie die Bedeutung haben: „fünf der sieben menschlichen Coronaviren haben in diesem Jahrhundert isoliert. Und leider sind die letzten drei mit Ängsten vor einer Epidemie, einer Pandemie oder dem Tod in unser Leben getreten .

Es war in 1930 in den Vereinigten Staaten , dass die erste Krankheit aufgrund eines corona beobachtet wurde, in Geflügel . Im folgenden Jahr beschrieb ein Arzt in einem Artikel die Krankheit, die bei der Henne Atemnot und eine Abnahme der Lege- und Eiqualität verursachte. In 1937 , der Erreger, die Infektiöse Bronchitis Virus (IBV für infektiöse Bronchitis - Virus wurde) isoliert.

In 1946 wurde ein weiterer corona identifiziert, das Coronavirus von übertragbaren Schweine Gastroenteritis (TGEV). Unabhängig davon entdeckten zwei Teams 1949 in New York und 1951 in London das Maus-Hepatitis-Virus in einer gelähmten Maus.

In 1965 wird die erste corona Menschen (Stamm infiziert B814 wurde) entdeckt. Und schnell folgen weitere: 229E im Jahr 1966 und OC43 im Jahr 1967 , die den Menschen zufolge die Ursache für mehr oder weniger schwere Erkältungen sind . Im folgenden Jahr werden sie von June Almeida und David Tyrrell unter einem Elektronenmikroskop beobachtet , die ihre Kronenstruktur demonstrieren. Die Beziehung zwischen allen diesen Viren hergestellt, und der Begriff „corona“ wird zum ersten Mal in der Zeitschrift verwendet Nature in 1968 .

Epidemie des XXI ten  Jahrhunderts

Coronavirus Pandemie

Das letzte menschliche Coronavirus (oder kürzlich humanisiert, höchstwahrscheinlich von einem oder mehreren von Fledermäusen getragenen Stämmen) scheint 2019 in Wuhan, China, aufgetaucht zu sein: SARS-CoV-2 . Die von ihr verursachte Krankheit ( Covid-19 ) verursachte die erste große Coronavirus-Pandemie seit wenigen Monaten, gekennzeichnet durch einen hohen R 0 (im Durchschnitt 2,3 nach den verfügbaren Schätzungen in .).April 2020, die aber anscheinend 5,7 erreichen kann); mit einer Sterberate von 6,3 (sehr variabel je nach Alter und Kontext, manchmal über 15%).

Coronavirus Pandemie
Pandemie Datiert Bestätigte Fälle Tod Heilungen Beteiligter Subtyp
2002-2004 SARS-Epidemie 2002-2004 8.096 774 - Sars-Cov (SARS)
Atemwegssyndrom im Nahen Osten Coronavirus 2012-2014 361 107 - MERS-CoV
Covid-19-Pandemie (laufend) 2019-2021 + 106 903 452 (10. Februar 2021) + 2 341 010 (10. Februar 2021) + 59 755 076 (10. Februar 2021) SARS-CoV-2 (Covid-19)
Sars-CoV-2-Pandemiedaten (2019-2021)   
Daten der Pandemie Covid-19 nach Land und Territorium
Setzt Bestätigt Tod Restauriert % Todesfälle pro
bestätigtem Fall
Todesfälle pro
Million Einwohner.
Art.-Nr.
200+ 179 723 542 5 3.894.122 - - -
Vereinigte Staaten 33 665 482 48 607.476 - - -
Indien - - - - -
Brasilien 18.169.881 507 109 16 483 635 2,79 % 2 413
Frankreich 5.760.002 110 858 - 1,92% 1.671
Truthahn 5.393.248 49.417 5.254.708 0,92 % 591
Russland 5 388 695 131.463 4 915 615 2,44 % 895
Vereinigtes Königreich 4.684.572 128.048 - 2,73 % 1 955
Italien 4.254.294 127.322 4.054.008 2,99% 2 111
Argentinien 4 328 038 90 986 3 944 260 2,1% 2.025
Deutschland 3.741.685 90 953 3.600.881 2,43 % 1.094
Spanien 3.773.032 80.748 - 2,14 % 1.728
Kolumbien 4.027.016 101 947 3.741.459 2,53% 2.078
Iran 3 140 129 83.473 2 797 105 2,66% 1.044
Polen 2 879 336 74 917 2.651.045 2,6% 1 952
Mexiko 2.487.747 231.847 1 979 823 9,32% 1.858
Ukraine 2.231.914 52.181 2.157.732 2,34 % 1 226
Peru 2.036.449 191.073 1.994.330 9,38 % 6.503
Indonesien - - - - -
Südafrika 1 877 143 59,406 1.675.827 3,16% 996
Tschechien 1.666.521 30.291 1.634.010 1,82% 2.830
Niederlande 1.678.983 17 726 - 1,06% 1.046
Chile 1.531.872 31.797 1.468.137 2,08% 1.761
Kanada 1.413.323 26 168 1 375 596 1,85% 691
Philippinen 1.378.260 24.036 1.302.814 1,74 % 238
Irak 1.305.000 16 968 1.213.952 1,3 % 443
Rumänien 1.080.457 32.771 1.045.303 3,03% 1.673
Schweden 1.088.896 14.619 - 1,34% 1.408
Belgien 1.081.061 25.149 - 2,33 % 2.200
Pakistan 951 865 22.108 896.821 2,32% 102
Portugal 869 879 17.079 823 103 1,96% 1.659
Israel 840.032 6.428 832 923 0,77% 707
Ungarn 807 684 29.963 735 937 3,71% 3.067
Bangladesch 872 935 13.868 794 783 1,59% 84
Japan 789.440 14 553 756.293 1,84% 115
Jordanien 739.847 9.530 721.016 1,29% 914
Serbien 716.096 7.019 - 0,98% 1000
schweizerisch 702.124 10.329 317.600 1,47% 1.220
Österreich 649.922 10 697 636 923 1,65% 1214
Malaysia 716.847 4 721 650.964 0,66% 149
Vereinigte Arabische Emirate 620 309 1775 599,131 0,29 % 189
Flagge von Nepal Nepal 629.431 8 918 570 958 1,42% 294
Libanon 543.865 7 832 528 643 1,44% 1.284
Marokko 528 180 9,265 515.030 1,75% 257
Saudi Arabien 479.390 7 730 460.338 1,61% 234
Ecuador 449.483 21 377 415.508 4,76% 1.286
Bulgarien 421 339 18.013 393 870 4.28% 2.573
Griechenland 418 943 12.575 363 915 3% 1.169
Weißrussland 413.139 3.082 405.909 0,75% 330
Slowakei 391 456 12.502 - 3,19 % 2316
Kasachstan 410 523 4.249 386.127 1,04% 232
Panama 396.526 6.491 378.954 1,64% 1.584
Bolivien 426.748 16.329 346.879 3,83% 1.478
Kroatien 359.403 8 192 350 669 2,28% 1.995
Paraguay 411 615 11 973 352.014 2,91% 1.758
Tunesien 501 923 16.494 340 834 3,66% 1 238
Georgia 361 484 5 228 347.653 1,45% 1.406
Aserbaidschan 335 676 4 965 329 870 1,48% 490
Costa Rica 357.523 4.567 283 935 1,28% 931
Kuwait 344.799 1.894 324.578 0,55% 412
Uruguay 360,247 5 374 332 112 1,49% 1.555
Dominikanische Republik 319.254 3.773 261 222 1,18% 363
Dänemark 292 352 2.531 286.366 0,87 % 443
Litauen 278.590 4 375  267.055 1,57% 1.568
Äthiopien 275.601 4.296 257.429 1,56% 41
Ägypten 278 761 15.967 207 411 5,73% 168
Irland 267.949 4.979 - 1,86% 1.046
Moldawien 256.387 6.180 249.381 2,41 % 2 423
Guatemala 284.741 8 845 257.397 3,11 % 512
Slowenien 257.116 4.417 - 1,72 % 2 137
Honduras 255.663 6.844 92.014 2,68% 739
Bahrain 264 107 1330 256 933 0,5% 891
Venezuela 264.551 3.007 245.519 1,14% 105
Armenien 224.533 4.505 216 312 2,01% 1.537
Katar 221.378 587 218,928 0,27 % 222
Oman 737.830 2.639 703 940 0,36% 546
Bosnien und Herzegowina 204.936 9 653 181.199 4,71% 2 752
Sri Lanka 246 109 2.769 211.186 1,13% 129
Libyen 191.476 3 183 176.869 1,66% 477
Kenia 181.239 3.538 123.462 1,95% 73
Nigeria 167.375 2 118 163.917 1,27% 11
Thailand 232 647 1775 191 355 0,76% 27
Nordmazedonien 155.627 5 477 149 877 3,52% 2.639
Birma 150 714 3.275 134.589 2,17% 61
Kuba 172.909 1.193 162.531 0,69% 104
Südkorea 153.155 2.008 144 788 1,31% 39
Lettland 137 110 2.500 133,141 1,82% 1310
Albanien 132.499 2 455 129.966 1,85% 813
Estland 130.898 1.269 126.968 0,97 % 958
Algerien 137.049 3.660 95 331 2,67% 89
Norwegen 130.035 792 88 952 0,61% 147
Kosovo 107.571 2 249 104.791 2,09% 1 194
Kirgisistan 118 106 1.958 106 858 1,66% 316
Usbekistan 107.708 723 103.472 0,67% 22
Montenegro 101 131 1.609 98.243 1,59% 2.585
Sambia 140 620 1 855 115.898 1,32% 109
Ghana 95.259 794 93.148 0,83% 30
Finnland 94 719 969 31.000 1,02% 176
China 91 669 4.636 86.541 5,06% 3
Kamerun 80.487 1320 57.008 1,64% 55
Salvador 77.484 2 351 71.603 3,03% 366
Zypern 73 832 374 - 0,51% 328
Afghanistan 111.532 4.519 66.799 4,05 % 123
Mosambik 73 652 863 70 352 1,17% 29
Luxemburg 70.586 818 69.555 1,16 % 1.306
Malediven 72.466 207 67 886 0,29 % 474
Singapur 62.448 35 62.098 0,06% 6
Mongolei 102.629 482 66.602 0,47% 157
Namibia 78 723 1.279 62.026 1,62% 505
Botswana 61.457 1.069 59.616 1,74 % 466
Jamaika 49.841 1.049 29.322 2,1% 363
Elfenbeinküste 47.760 306 47.239 0,64 % 13
Uganda 75 357 781 50 350 1,04% 18
Senegal 42 333 1.158 40 767 2,74 % 73
Madagaskar 42,161 905 40.450 2,15% 35
Zimbabwe 43.480 1.692 37.477 3,89% 102
Sudan 36.558 2.750 30.404 7,52% 68
Angola 38.002 878 32 322 2,31 % 29
Malawi 35 115 1.177 32 948 3,35% 63
Demokratische Republik Kongo 38 936 896 28 115 2,3% 10
Kambodscha 44 711 475 39.314 1,06% 30
Malta 30.598 420 30.151 1,37% 903
Grüne Kappe 32 192 284 31.202 0,88% 520
Australien 30.408 910 - 2,99% 37
Ruanda 33.260 397 26.734 1,19 % 33
Syrien 25 118 1.845 21.738 7,35% 100
Gabun 24 958 159 24.509 0,64 % 79
Trinidad und Tobago 31.207 768 22.630 2,46 % 561
Guinea 23.615 168 22.379 0,71% 13
Mauretanien 20.473 483 19.514 2,36 % 109
Eswatini 18.898 677 18.050 3,58% 602
Guyana 19 359 454 17.297 2,35% 584
Papua Neu-Guinea 17.079 173 16.480 1,01% 19
Surinam 20 549 482 15.731 2,35% 856
Somalia 14.776 773 6.985 5,23% 70
Haiti 17.710 393 12 753 2,22% 36
Mali 14 385 524 10.038 3,64% 28
Andorra 13.864 127 13 665 0,92 % 1.667
Tadschikistan 13 714 90 13.218 0,66% 10
Gehen 13 749 128 13.379 0,93% 16
Burkina Faso 13.468 167 13.290 1,24% 9
Belize 13.004 328 12.551 2,52 % 875
Hongkong 11.906 210 11 598 1,76% 28
Bahamas 12.295 241 11 230 1,96% 610
Republik Kongo 12.404 164 8 208 1,32% 31
Seychellen 14.620 59 13 323 0,4% 616
Dschibuti 11 587 155 11.424 1,34% 162
Lesotho 11 128 329 6.445 2,96% 147
Südsudan 10 688 115 10.514 1,08% 9
Äquatorialguinea 8.708 120 8 489 1,38% 95
Taiwan 14.389 605 - 4,2% 26
Gutartig 8 170 104 8.000 1,27% 9
Nicaragua 7 877 189 - 2,4% 30
Vietnam 14 116 72 5 759 0,51% 1
Zentralafrikanische Republik 7.139 98 5 112 1,37% 21
Osttimor 8.843 19 7 838 0,21% fünfzehn
Jemen 6 877 1.353 3 855 19,67 % 48
Island 6 637 30 6 595 0,45% 84
Gambia 6.054 181 5.844 2,99% 86
Niger 5.469 193 5 178 3,53% 9
San Marino 5.090 90 4.998 1,77 % 2.695
St. Lucia 5 238 84 5.084 1,6 % 470
Tschad 4.946 174 4 768 3,52% 11
Burundi 5.300 8 773 0,15% 1
Sierra Leone 4 816 82 3 264 1,7 % 11
Eritrea 5,608 21 5.078 0,37% 6
Komoren 3 912 146 3.745 3,73% 177
Guinea-Bissau 3.825 69 3562 1,8 % 37
Liechtenstein 3 031 59 2 957 1,95% 1.556
Monaco 2.557 33 2.491 1,29% 853
Sao Tome und Principe 2363 37 2316 1,57% 181
Neuseeland 2 362 26 2.314 1,1% 5
Liberia 3.265 110 2 222 3,37% 23
Laos 2.060 3 1 962 0,15% 0
Bhutan 1 963 1 1.702 0,05% 1
Mauritius 1.779 18 1331 1,01% 14
Antigua und Barbuda 1.263 42 1 221 3,33% 412
Diamantprinzessin 712 14 698 1,97% 3.773
Tansania - - - - -
Fidschi 2.549 13 636 0,51% 14
Brunei 252 3 243 1,19 % 7
Barbados 236 7 218 2,97  % 24
Dominica 192 0 189 0% 0
Granate 160 1 158 0,63% 9
St. Vincent und die Grenadinen 98 0 81 0  % 0
St. Kitts und Nevis 396 3 92 0,76% 54
Macao 53 0 51 0% 0
Vatikan 29 0 27 0% 0
Westsahara 28 2 26 0  % 0
Salomon-Inseln 13 0 4 0  % 0
MS Zaandam 13 4 - 30,77% 2 187
Marshallinseln 4 0 0 0  % 0
Samoa 3 0 1 0% 0
Vanuatu 3 0 3 0% 0
Die Verbündeten Staaten von Micronesia 1 0 0 0  % 0

Charakterisierung

Die Taxonomie dieser neuen Viren wird zunächst diskutiert, was schließlich 1975 zur Schaffung einer neuen Familie ( Coronaviridae ) und einer neuen Unterfamilie ( Orthocoronavirinae ) durch das International Committee on Taxonomy of Viruses führte .

Konfession

Der Begriff Coronavirus ( lateinisch Corona und Viren , wörtlich "Kronenvirus") kommt vom Erscheinen von Virionen im Elektronenmikroskop , gekennzeichnet durch einen Rand großer Ausstülpungen, die die Hülle mit dem Aussehen einer Krone umgeben , in Analogie zur Sonnenkorona .

Virus-Hosts

Die idealen Wirte für Coronaviren als warmblütige fliegende Wirbeltiere sind Fledermäuse (für Alphacoronaviren und Betacoronaviren ) und Vögel (für Gammacoronaviren und Deltacoronaviren ) . Diese Reservoir-Arten sorgen für die Evolution und Verbreitung von Coronaviren. Bei anderen Tierarten variieren die Symptome (Erkrankungen der oberen Atemwege bei Hühnern , Durchfall bei Kühen oder Schweinen , Verdauungstrakt bei Katzen und Hunden usw.). Manchmal sind mit ihrem Vorhandensein keine Symptome verbunden (z . B. Beluga-Coronavirus ).

Als Mensch ist die Heimat von vier Arten von natürlich mild corona, die Ursache von Infektionen der Atemwege , wie die gewöhnliche Erkältung , und nur selten die Auswirkungen auf Magen - Darm - System , Herz und Nerven .

Coronavirus-Gruppen haben normalerweise einen bestimmten tierischen Wirt ( Säugetiere oder Vögel), aber sie können manchmal aufgrund einer Mutation den Wirt wechseln . Es sind solche Mutationen, die wahrscheinlich zum Auftreten von Stämmen geführt haben, die beim Menschen schwere Infektionen verursachen ( SARS , MERS und Covid-19 ).

Tropismus

Lange wurde angenommen, dass Coronaviren einen ausschließlich respiratorischen oder gastrointestinalen Tropismus haben (ausgedrückt durch Lungenentzündung und Enterokolitis in schweren Fällen), aber eine wachsende Zahl von Studien zeigt einen viel breiteren Tropismus, insbesondere kardiovaskuläre und auch neurologische (ab frühen Stadien). Es hat sich gezeigt, dass mehrere Coronaviren, von denen im letzten Fall SARS-CoV-2 eindeutig auch neuroinvasiv und neurotrop ist, bis zu dem Punkt, dass diese Vielfalt an Tropismen und Symptomen Coronaviren (insbesondere Maus, zusammengefasst unter dem Akronym MHV) ausmacht. ein Tiermodell zur Erforschung von so unterschiedlichen menschlichen Erkrankungen wie Multipler Sklerose , Virushepatitis oder Pneumonie (SR Weiss et al. 2011). MHV gelangt über Neuronen im Nervengeruch in das zentrale Nervensystem (ZNS) und kann eine akute Enzephalitis verursachen oder chronische demyelinisierende Erkrankung, wenn sie fortbesteht (sie kann sich auch auf das Rückenmark ausbreiten ).

Forschung

Im Jahr 2002 veranlasste das Auftreten von Sars-CoV, einem Virus, das für eine Infektionskrankheit der Lunge verantwortlich ist, die Europäische Union, mehrere Programme zu starten, um bei neuen Notfällen nicht überrascht zu werden. Seit 2004 hat das Team von Bruno Canard, CNRS-Forschungsdirektor in Aix-Marseille, Spezialist für Coronaviren, dank europäischer Kooperationsnetzwerke vielversprechende Ergebnisse gezeigt. „Wir hatten diese Idee, die sich als fruchtbar herausstellte: Viren haben eine enorme Fähigkeit, bei großen Familien unterschiedlich und vielfältig zu sein. Wir haben sie daher alle gleichzeitig untersucht, um ein Standardmodell zu haben, das es uns im Falle einer Bedrohung durch einen unbekannten Virus ermöglicht, einen nahen Virus zu finden, aus dem wir wissenschaftliche Daten extrahieren können. ".

Doch ab 2006 verschwand das Interesse der Politiker für Sars-CoV. Die Finanzkrise von 2008 beschleunigte den Rückzug Europas und Frankreichs aus der Forschung, Strategien der Grundlagenforschung verloren ihre Finanzierung. Ebenfalls 2015 prangert Bruno Canard die europäische und französische Abkehr vom Wissenschaftssektor an und schickt mit seinen belgischen und niederländischen Kollegen Absichtserklärungen an die Europäische Kommission, in denen er erklärt, dass es neun Virenfamilien gibt, für die eine Entstehung möglich ist . „Das erste auf der Liste war das Flavivirus “, erklärt er. Das zweite, das Coronavirus. Ein Jahr später erschien Zika, ein Flavivirus“. Die Europäische Kommission wird jedoch niemals eine Antwort geben. Und 2020 erscheint Sars-CoV-2, ein Coronavirus, das Covid-19 verursacht .

Biologie

Morphologie

Dieses umhüllte Virus besteht aus einer Virushülle, die ein helikales Kapsid umgibt, das den RNA-Strang enthält. Die Genomgröße dieser Viren reicht von etwa 26 bis 32  Kilobasen , einer der höchsten Werte bei RNA- Viren .

Coronaviren haben gemeinsame Proteine, die durch einen Buchstaben gekennzeichnet sind, der ihre Position angibt: S (Protuberanzen), E (Hülle), M (Membran) und N (Nukleokapsid). Einige, insbesondere diejenigen der Untergruppe A der Gattung Betacoronavirus , haben ein charakteristisches HE-Protein ( Hämagglutinin-Esterase  (en) ). Der SARS - Coronavirus auch präsentiert auf Protein S eine spezifische Bindungsstelle für die Angiotensin - Converting - Enzym - 2 , die als Eintrittspunkt in dem dient Wirtszelle .

Die physikalische Größe des Virions wird üblicherweise mit 120 bis 160  nm oder in der Größenordnung von 125  nm angegeben . Jedoch SARS-CoV-2 , verantwortlich für Covid-19, wurde als die ungefähr 60 bis 140 mehr vor kurzem angekündigt  nm , und als eine elliptische Form mit vielen Variationen.

Genom

Alle CoVs haben ein nicht segmentiertes (einzelsträngiges) RNA-Genom, das auf die gleiche Weise organisiert ist: Etwa zwei Drittel des Genoms enthalten zwei große, sich   überlappende „ offene Leseraster “ (bekannt als ORF1a und ORF1b ). Diese beiden Gerüste werden in "  Polyprotein- Replicase" pp1a und pp1ab übersetzt . „Diese Polyproteine ​​werden dann verarbeitet, um 16 nicht-strukturelle Proteine ​​zu erzeugen, die als nsp1 ~ 16 bezeichnet werden. Der verbleibende Teil des Genoms enthält ORFs für Strukturproteine, einschließlich Spitze (S), Hülle (E), Membran (M) und Nukleoprotein ( N). Eine Reihe von linienspezifischen akzessorischen Proteinen wird auch von verschiedenen CoV-Linien kodiert “ .

Reproduzieren

Dies geschieht in sechs aufeinanderfolgenden Schritten (siehe Abbildung):

  1. Coronaviren binden dank ihres S-Proteins an Zelloberflächenmoleküle wie Metalloproteinasen . Viren mit dem Zusatz des HE-Proteins (Hämagglutinin-Esterase) in ihrer Hülle können auch an N-Acetylneuraminsäure binden, die als Co-Rezeptor dient (selbst Initiator des Eindringens eines Pathogens in eine Wirtszelle). Es ist nicht klar, ob Viren durch Fusion von Virus- und Zellmembranen oder durch Rezeptorinternalisierung in die Wirtszelle gelangen . Was auch immer der Mechanismus ist, der RNA-Strang wird in die Zelle eingefügt und das Kapsid (die Hülle) wird aufgegeben;
  2. Coronaviren haben ein einzelsträngiges RNA- Genom , das jetzt im Zytoplasma vorhanden ist . Das Coronavirus-RNA-Genom hat eine 5'-methylierte Kappe und einen 3'-polyadenylierten Schwanz, der es der RNA ermöglicht, zur Translation an Ribosomen zu binden. Die Ribosomen der Zelle entschlüsseln die virale RNA und produzieren die darin kodierten Proteine;
  3. Zuerst wird die positive RNA des Virus in Protein transkribiert, um seine eigene RNA-Polymerase (eine RNA-abhängige RNA-Polymerase ) zu bilden. Replikase ist das erste hergestellte Protein; Sobald das für die Replikase kodierende Gen vom Ribosom der Wirtszelle translatiert wurde, wird die Translation durch ein Stoppcodon gestoppt. Diese virale Replikase erkennt und produziert nur virale RNA und ermöglicht die Transkription des viralen Genoms in neue Kopien der RNA unter Verwendung der Maschinerie der Wirtszelle. Unter Verwendung des positiven Strangs als Matrize baut dieses Enzym den negativen Strang zusammen;
  4. anschließend dient dieser negative Strang selbst als Matrize für die Transkription kleiner subgenomischer RNAs, die zur Herstellung aller anderen Proteine ​​verwendet werden. Dies wird als verschachtelte Transkription bezeichnet. Dieser Prozess ist eine Form der genetischen Ökonomie, die es dem Virus ermöglicht, die größte Anzahl von Genen in einer kleinen Anzahl von Nukleotiden zu kodieren;
    das Genom des negativen Strangs wird vom Ribosom der Wirtszelle translatiert und es entsteht ein langes Polyprotein, an das alle viralen Proteine ​​gebunden sind. Coronaviren besitzen ein nicht-strukturelles Protein – eine Protease – die das Polyprotein spalten kann.
    Darüber hinaus spielt dieser negative Strang eine Rolle bei der Replikation neuer positiver RNA-Genome.
    Das Zytoplasma der Wirtszelle füllt sich mit viralen Proteinen und RNAs;
  5. (a) das N-Protein hilft, genomische RNA an die Einkapselung des viralen Genoms in einer als Kapsid bezeichneten Schutzhülle zu binden  ; das M-Protein integriert sich auf der Kapsidseite in die Membran des endoplasmatischen Retikulums ; und HE- und S-Proteine ​​durchqueren die Membran des endoplasmatischen Retikulums über das Translokationsprotein und positionieren sich auf der gegenüberliegenden Seite;
    (b) mit der Bindung zwischen dem Kapsid und den M-Proteinen stülpt sich die Retikulummembran ein und knospt. Das zusammengesetzte Kapsid (die Hülle), das mit helicaler RNA ausgestattet ist, befindet sich dann im Inneren des endoplasmatischen Retikulums, nachdem es die Membran des letzteren eingefangen hat, die nun die HE- und S-Proteine ​​​​auf ihrer Außenseite trägt;
  6. diese virale Nachkommenschaft wird dann (a) eingekapselt und von Golgian- Vesikeln zur Zellmembran transportiert, (b) um schließlich (durch Exocytose ) außerhalb der Zelle nach außen getragen zu werden.

Coronavirus Infektion

Infektionsarten

Sieben Arten von Coronaviren infizieren häufig Menschen, von denen drei schwere Infektionen verursachen.

Leichte Infektionen

Die ersten vier bekannten Typen sind nicht schwerwiegend: die menschlichen Coronaviren 229E , NL63 , OC43 und HKU1 , die bei Fledermäusen unbekannt sind. Sie verursachen Erkältungen mit Fieber und Halsschmerzen durch geschwollene Polypen, vor allem im Winter und im zeitigen Frühjahr.

Es wird angenommen, dass Coronaviren die Ursache für 15 bis 30 % der Erkältungen sind.

Schwere Infektionen

Drei Arten von Coronaviren, die nicht natürlich beim Menschen, sondern bei Säugetieren vorkommen, wurden in jüngerer Zeit entdeckt und haben schwere Lungeninfektionen ( virale Lungenentzündung ) verursacht:

  • die SARS-CoV , Erreger von Atemwegssyndrom schwere akute (SARS) , die die Epidemie von 2002 bis 2004 führte zu einer globalen WHO - Alarm. Es begann in China nach dem Verzehr eines wilden Tieres, der maskierten Zibetpalme , in einem Restaurant . Die Krankheit hat 774 Menschen getötet (rund 10 % der Betroffenen). Es gilt seit 2004 als ausgerottet;
  • das MERS-CoV , das des Atemwegssyndroms des Nahen Ostens, dessen erste Epidemie 2012 in Saudi-Arabien ausbrach. Seine Sterblichkeitsrate betrug 35%, was 449 Opfer allein aufgrund der geringen Anzahl betroffener Personen machte. Sie wäre durch den Verzehr von Kamelmilch und durch die Nähe zu den Kamelen ausgelöst worden. Diese Krankheit existiert immer noch, denn um sie auszurotten, sollten die Bevölkerungen, die traditionell Kamele verwenden, auf sie verzichten können;
  • die SARS-CoV-2 , das von Krankheit corona 2019 (Covid-19) erschien in China im Jahr 2019 und verantwortlich für eine schwere Pandemie im Jahr 2020 . Der Verzehr von Schuppentier und Fledermausfleisch (in China als Lebensmittel verkauft) könnte die Ursache sein.

Schwere Formen der Erkrankung haben je nach Virus ihre Besonderheiten. Durchfall war beispielsweise bei SARS sehr häufig , bei der Coronavirus-Erkrankung 2019 jedoch selten .

Vergleich schwerer Infektionen

Drei Hauptquellen werden verwendet: das Institut Pasteur , die WHO und die US-amerikanische CDC .

Atemwegssyndrom im Nahen Osten (MERS) Schweres akutes respiratorisches Syndrom (SARS) Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19)
Agens pathogen MERS-CoV SARS-CoV SARS-CoV-2
Erscheinungsjahr 2012 2003 2019
Zahl der Fälle 1 219 8.098 davon 5.327 in China. In Bearbeitung, siehe hier
Prozentsatz der Fälle durch nosokomiale Übertragung 70% 58%
Anzahl der Todesfälle 449 774 (davon 349 in China) In Bearbeitung, siehe hier
Panzer Kamel Schläger Fledermaus (wahrscheinlich)
Übertragung von Tieren auf den Menschen Direkter Kontakt mit einem infizierten Tier, Verzehr von Kamelrohmilch . Verzehr von maskiertem Palmenzibetfleisch , einem Wildtier, das auf Märkten verkauft und in Südchina konsumiert wird. Ein Schuppentier könnte der Zwischenwirt sein.
Übertragung von Mensch zu Mensch Jawohl Jawohl Jawohl
Übertragung per Objekt - Jawohl Sehr geringes Risiko.
Mutter-Fötale Übertragung - Bei schwangeren Frauen, die mit diesem Virus infiziert waren, wurde kein Fall gefunden. Kein Beweis.
Übertragung durch Muttermilch Ein einziger dokumentierter Fall RT-PCR negativ bei 16 getesteten Frauen
Inkubation Zwischen 5 und 15 Tagen. Zwischen 2 und 7 Tagen. Mediane Inkubationszeit bei 5,1 Tagen (durchschnittlich 5,5 Tage), 97,5% der Menschen werden 11,5 Tage nach Infektionskontakt krank.
Gesunder Träger - Wahrscheinlich nicht. Ja (nur ein veröffentlichter Fall)
Ansteckung Reproduktionsrate kleiner als 1. Reproduktionsrate größer als 2. Median der Grundlinien-Reproduktionsrate (R 0 ) bei 2,79.
Dauer der Ansteckung - - Scheint auf den Zeitraum der klinischen Symptome beschränkt zu sein. Umstrittene Ansteckungsmöglichkeit in der asymptomatischen Phase.
Beginn der Ansteckungszeit - 3 bis 4 Tage nach Einsetzen der klinischen Symptome. Sobald klinische Anzeichen auftreten. Bewährter asymptomatischer Träger.
Fieber Bei 98% 99% Bei 87,9 %, kann jedoch mehrere Tage nach Husten oder Atembeschwerden auftreten.
Durchfall Bei 26 % Bei 20 %. Bei 3,7%.
Übertragung durch Stuhl Sehr wahrscheinlich, spielte aber eine untergeordnete Rolle. Diese Möglichkeit wird in Erwägung gezogen.
Tödlichkeit 34,4% 9,5%, über 50% für die über 65-Jährigen. 3,4%
Behandlung Symptomatisch Symptomatisch Symptomatisch
Impfung Irgendein Irgendein Im Gange
Status Mögliches Wiederaufleben. Gilt als ausgerottet. Epidemie im Gange.

Überschreitung der Bargeldschranke

Angesichts der verfügbaren genomischen Sequenzen wären zwei große Tiertaxa das Hauptreservoir für CoVs:

  • Fledermäuse  : natürliche Wirte von HCoV-NL63 und HCoV-229E;
  • Nagetiere  : natürliche Wirte von HCoV-OC43 und HKU1.

Coronaviren schienen angesichts des vorliegenden Wissens Zwischenwirte (immer Säugetiere) zu benötigen, um sie „humanisieren“, also mutieren zu können, um den Menschen infizieren zu können.
Bekannte Zwischenwirte waren:

Übertragung von Mensch zu Mensch

Informationen zur Pandemie 2019-2020 finden Sie in den Artikeln, deren Namen folgen.

Die Übertragung von Coronaviren von Mensch zu Mensch erfolgt hauptsächlich durch Atemtröpfchen oder Aerosole, die von einer infizierten Person ausgehustet werden (durch Husten, Niesen, Spucken oder manchmal einfach nur laut oder schreien ), wenn die Viruspartikel von einer Person in der Nähe eingeatmet werden. Übertragung und Ansteckung variieren auch je nach Coronavirus und möglicherweise je nach Belastung innerhalb einer Epidemie.

Die Prophylaxe erfordert eine Primärprävention, um die Übertragung des Virus zu begrenzen: Kontakt vermeiden (potenziell kontaminierte Oberflächen, Händeschütteln, Umarmungen), häufiges Händewaschen, Berührung von Augen, Nase oder Mund vermeiden, wo das Virus in den Körper gelangen kann Halten Sie bei Symptomen wie Husten oder Erkältung mindestens 1 Meter Abstand zu Personen und vermeiden Sie die Emission von kontaminierten Partikeln.

Weitere Empfehlungen sind:

  • nicht mit offensichtlich kranken Tieren in Kontakt kommen, kein Fleisch von kranken Tieren essen;
  • Essen Sie keine schlecht gekochten tierischen Produkte (Fleisch usw.) oder rohes Gemüse, wenn es nicht mit sauberem Wasser gewaschen wurde.

Behandlung

Im Fall von SARS wurden Medikamente eingesetzt, um die Epidemie einzudämmen: Ribavirin , ein Nukleotidanalogon, steroidale entzündungshemmende Medikamente und nach formaler Identifizierung des Erregers und Sensitivitätsscreenings die „ Interferon-Alpha- und Protease-Inhibitoren“ . Ihre Wirksamkeit ist noch fraglich. Keine war Gegenstand einer angemessenen klinischen Studie: Viele verfügbare Studien lassen keine klaren wissenschaftlichen Schlussfolgerungen zu, da sie an einer kleinen Anzahl von Probanden oder ohne Protokoll oder feste Dosis durchgeführt wurden. Einige weisen sogar darauf hin, dass diese Behandlungen die Ausrottung des Virus beeinflusst haben könnten.

Bruno Canard denunziert in März 2020Ausreißer und veröffentlicht einen offenen Brief Coronavirus: Wissenschaft arbeitet nicht in Eile! . Er sagt: „Ein Impfstoff braucht bestenfalls 18 Monate Forschung. Und für unberechenbare Viren, die sich verändern, ist es nicht geeignet. Es ist besser, Medikamente herzustellen, die ein breites Spektrum in einer Virusfamilie haben. Dies kann 5 Jahre dauern, manchmal 10. Daher ist die wissenschaftliche Vorwegnahme wichtig. ".

Impfungen

Die schnelle Ausrottung der früheren SARS-Epidemie hat nicht viel Raum für klinische Studien gelassen. Von Impfstoffen auf Basis von inaktivierten Viren und anderen auf Basis der S- und N-Proteine ​​werden seit mehreren Jahren geprüft. Bei Impfstoffen sind die Immunität erzeugenden viralen Elemente in derselben Virusfamilie oft nicht ausreichend konserviert. „Wenn es also einen Impfstoff gegen das Coronavirus von 2003 gegeben hätte, wäre es so gut wie sicher, dass er gegen Covid-19 nicht zufriedenstellend gewirkt hätte“ (Bruno Canard).

Taxonomie

Benennung von Coronaviren

Coronaviren werden von einer Studiengruppe benannt, die innerhalb des ICTV ( International Committee on Taxonomy of Viruses ) arbeitet.

Einstufung

Die corona ( CoV ) ist RNA - Viren , Einzelstrang des Sinn positiv (Gruppe IV der Baltimore Klassifizierung ) entsprechend der Unterfamilie Orthocoronavirinae die Taxonomie von ICTV , der Familie Coronaviridae , und um Nidovirales .

Nach den Eigenschaften ihrer Proteinsequenzen werden CoVs in 4 Gattungen (Alpha-CoV, Beta-CoV, Gamma-CoV und Delta-CoV) eingeteilt, die alle für Säugetiere pathogene Viren enthalten:

  1. Alphacoronavirus , zu dem dasporcine epidemische Durchfallvirus(PEDV), dasVirus der porcinen übertragbaren Gastroenteritis(TGEV), dasCoronavirus des akuten DurchfallsyndromsbeimSchwein(SADS-CoV), dasHunde-Coronavirus, dasenterische Coronavirus feline, dasfelineinfektiöse Peritonitis-Virus(FIPV) gehören ;
  2. Betacoronavirus , einschließlich SARS-Atemwegs-Atemwegs-Virus (SARS-CoV),SARS-CoV-2, Nahost-Atemwegssyndrom-Coronavirus (MERS-CoV), Maus-Hepatitis-Virus (MHV), Rinder-Coronavirus , Ratten-Sialodacryoadenitis-Virus, Sialodacryoadenitis-Virus beim Schwein, Schweine Hämagglutinose, Schweine-Hämagglutinose-Virus equines Coronavirus. In dieser Betacoronavirus-Gattung gehörenSARS-CoVundSARS-CoV-2beide zur Sarbecovirus- Untergattung,in der drei verschiedene Kladen identifiziert wurden:
    -Klade1: "Fledermaus"-Stämmeaus Bulgarien und Kenia;
    -Clade2: SARS-CoV-2 und „Fledermaus“-Stämmeaus Ostchina;
    - Clade3: SARS-CoV und „Fledermaus“-Stämmeaus Südwestchina:
  3. Gammacoronavirus : kommt hauptsächlich bei Zugvögeln vor und verursacht insbesondere Bronchitis; ein Gammacoronavirus wurde aus einem inGefangenschaft gehaltenenBelugaisoliert,
  4. Deltacoronavirus : Kürzlich bekannt, das hauptsächlich Vögel zu infizieren scheint, aber auch bei Schweinen gefunden wird.

Anmerkungen  :

  • Ein Coronavirus wird manchmal nach der Tierart benannt, bei der es zuerst gefunden wurde (z. B.: canines respiratorisches Coronavirus oder CRCoV für Canines respiratorisches Coronavirus , Virus der Gattung Betacoronavirus und seiner Untergruppe 2a).
  • Das letzte im Jahr 2019 gefundene Coronavirus ist SARS-CoV-2 , das für die Covid-19-Pandemie verantwortlich ist .

Liste der Arten

Die Orthocoronavirinae- Unterfamilie der Coronaviridae- Familie ist in 4 Gattungen, 22 Untergattungen und etwa vierzig Arten unterteilt:


Anmerkungen

  1. Beinhaltet Fälle aus Puerto Rico und den Amerikanischen Jungferninseln .
  2. Eingeschlossen sind Fälle in Guadeloupe , Guyana , Réunion , Martinique , Mayotte , Neukaledonien , Französisch-Polynesien , Saint-Barthélemy , Saint-Martin und Saint-Pierre-et-Miquelon .
  3. Johns-Hopkins University, die bestätigte und wahrscheinliche Fälle hinzufügt, Daten von Public Health France werden für Frankreich verwendet ( Quelle ).
  4. Die nebenstehenden Zahlen berücksichtigen nicht die Aussage der für Gesundheit zuständigen stellvertretenden Premierministerin Tatiana Golikova, die am 28. Dezember angab, dass COVID-19 seit Beginn der Pandemie 186.000 Menschen getötet hätte. Siehe "  Moskau gibt zu , dass die Zahl der Todesopfer durch Covid-19 in Russland dreimal so hoch ist wie die offizielle Zahl  " auf Le Monde .29. Dezember 2020
  5. Umfasst Fälle, die in Anguilla , den Bermudas bis Gibraltar , den Kanalinseln , den Kaimaninseln , den Inseln Türkei und Caicosinseln , den Britischen Jungferninseln auf der Isle of Man und Montserrat gemeldet wurden .
  6. Eingeschlossen sind Fälle, die in Aruba , Curaçao und Saint-Martin identifiziert wurden .
  7. Die Gesamtzahl der registrierten Todesfälle in10. Aprilgliedern sich wie folgt: 57  % traten im Krankenhaus auf, 40  % in Pflege- und Pflegeheimen (ohne Bestätigungstest), 1  % beim Patienten zu Hause und für 2  % liegen die Angaben laut Sciensano nicht vor .
  8. Eingeschlossen sind Fälle aus Grönland und den Färöer-Inseln .

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Siehe auch

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Infografiken

Verwandte Artikel

Externe Links