Caenorhabditis

Caenorhabditis Beschreibung dieses Bildes, auch unten kommentiert Erwachsener Hermaphrodit Caenorhabditis elegans . Einstufung
Herrschaft Animalia
Ast Nematoden
Klasse Sezernentea
Auftrag Rhabditida
Familie Rhabditidae

Nett

Caenorhabditis
( Osche  (d) , 1952 ) Dougherty , 1955

Synonyme

Caenorhabditis ist eine Gattung von Nematoden, die in bakterienreichen Umgebungen leben. Es enthält den Modellorganismus Caenorhabditis elegans sowie viele andere Arten, deren Genom sequenziert wurde.

Der Name setzt sich aus den beiden griechischen Wurzeln caeno- (καινός (caenos), rezent) und Rhabditis (ῥάβδος (rhabdos), Stab, Stock) zusammen.

Liste der Arten

Laut NCBI (30. Oktober 2019) gehört die Gattung zur Unterfamilie Peloderinae mit den Gattungen Pellioditis und Pelodera und umfasst folgende Arten:

andere unbenannte Caenorhabditis- Arten :

Laut ITIS (27. März 2011)  :

Genetik

Liste der sequenzierten Arten

Phylogenetische Studien

Cladogramm von Caenorhabditis- Arten nach Félix et al. (April 2014)
Caenorhabditis

Elegans

C. unerwartet



C. sp. 35


Elegans





C. briggsae



C. nigoni




C. sinica





C. Latenzen



C. remanei






C. wallacei



C. Tropicalis





C. brenner



C. Digertyi





C. elegans



Japonica





C. nouraguensis



C. yunquensis




C. Makrosperma





C. afra



C. imperialis





C. japonica




C. kamaaina




Drosophila




C. drosophilae



C. sp. 2






C. angaria



C. castelli




C. sp. 8






C. portoensis



C. virilis





C. Guadeloupensis






C. monodelphis



C. plicata




Cladogramm der Caenorhabditis- Spezies , basierend auf dem Vergleich von Sequenzen des " Intern transkribierten Spacers ", einem DNA-Abschnitt, der sich zwischen den Genen der kleinen und der großen RNA-Untereinheit befindet.

Eine im Jahr 2014 durchgeführte phylogenetische Studie ergab das Vorhandensein von zwei Supergruppen, „Elegans“ und „Drosophilae“, und zwei Gruppen („Elegans“ und „Japonica“) innerhalb der „Elegans“-Supergruppe. Diese Studie zeigt auch , dass C. nigoni ist die Schwester Spezies von C. briggsae während C. elegans Single ist, basal in der Gruppe ‚Elegans‘.

Eine weitere Studie aus dem Jahr 2019 fügt C. inopinata als die nächste Art zu C. elegans hinzu . Es zeigt auch, dass C. monodelphis die basalste Art im phylogenetischen Baum ist.

Hinweise und Referenzen

  1. (in) Osche, G., 1952. "Phylogeny Systematik und der Gattung Rhabditis (Nematoda)." Zoologische Jahrbücher (Abt. 1), 81, S.  190–280 .
  2. NCBI , abgerufen am 30. Oktober 2019.
  3. ITIS , abgerufen am 27. März 2011
  4. (en) Stein, LD et al. , "  Die Genomsequenz von Caenorhabditis briggsae : Eine Plattform für vergleichende Genomik  " , PLoS Biology , vol.  1, n o  22003, s.  166–192 ( PMID  14624247 , PMCID  261899 , DOI  10.1371 / journal.pbio.0000045 , online lesen )
  5. (in) The C. elegans Sequencing Consortium, „  Genomsequenz des Nematoden C. elegans : eine Plattform zur Untersuchung der Biologie  “ , Science , vol.  282,1998, s.  2012–2018 ( DOI  10.1126 / science.282.5396.2012 , online lesen )
  6. (in) Felix, Marie-Anne; Braendle, Christian; Cutter, Asher D. (11. April 2014). „Ein stromlinienförmiges System für die Artendiagnose bei Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) mit Namensbezeichnungen für 15 verschiedene biologische Arten“. PLUS EINS. 9: e94723. DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723
  7. (de) Vergleichende Genomik von 10 neuen Arten Caenorhabditis. Lewis Stevens, Marie – Anne Félix, Toni Beltran, Christian Braendle, Carlos Caurcel, Sarah Fausett, David Fitch, Lise Frézal, Charlie Gosse und Taniya Kaur, Evolution Letters, Volume3, Issue2, April 2019, Seiten 217-236, DOI : 10.1002 /evl3.110 .

Externe Links