OpenBabel
OpenBabel
| Entwickelt von | das OpenBabel-Entwicklungsteam |
|---|---|
| Letzte Version | 3.1.1 (8. Mai 2020) |
| Anzahlung | github.com/openbabel/openbabel |
| Geschrieben in | C ++ |
| Betriebssystem | Microsoft Windows |
| Umgebung | Plattformübergreifend |
| Formate lesen | Chemical Markup Language , International Chemical Identifier , MDL Molfile ( d ) , Proteindatenbank ( en ) , FASTA , Alchemieformat ( d ) , Gaußsche Würfeldatei ( d ) , CDX-Format ( en ) , Kristallographische Informationsdatei , Format .xyz , Free Form Fractional - Format ( d ) und MCDL Format ( d ) |
| Schriftliche Formate | Vereinfachte Molecular Input Line Eintrag Spezifikation , Chemical Markup Language , International Chemical Identifier , InChIKey ( d ) , MDL MolFile ( d ) , Multi - Level - Nachbarschaften der Atome Format ( d ) , Free Form Fractional - Format ( d ) , MCDL Format ( d ) und CAChe MolStruct ( d ) |
| Sprachen | Mehrsprachig |
| Art |
Software - Bibliothek Chemie - Software ( d ) |
| Lizenz | GNU General Public License Version 2 oder höher ( d ) |
| Webseite | openbabel.sourceforge.net |
Die freie Software OpenBabel ist ein Expertensystem, das hauptsächlich in Anwendungen der Chemoinformatik zur Konvertierung chemischer Strukturdateien verwendet wird. Diese Software ist für Windows , Unix und Mac OS verfügbar . Es wird unter der GNU GPL- Lizenz vertrieben .
Ziel des Open Babel-Wissenschaftsprojekts ist es, Benutzern und Entwicklern eine Reihe plattformübergreifender Softwareprogramme und Bibliotheken zur Verfügung zu stellen, die für die molekulare Modellierung, Chemie und viele verwandte Bereiche wie die Konvertierung von Dateiformaten und Daten entwickelt wurden.
Historisch
OpenBabel und JOELib sind von der OELib- Softwarebibliothek abgeleitet . OELib basierte auf Konzepten aus dem Babel-Programm und der Obabel- Softwarebibliothek .
Haupteigenschaften
- Experte Chemiesystem
- Interkonvertieren vieler chemischer Datendateiformate.
- Suche nach Unterstrukturen (basierend auf SMARTS- Deskriptoren )
- Berechnung des binären Fingerabdrucks
- Python- Adapter
- Perl Adapter
Anmerkungen und Referenzen
- " Release 3.1.1 " ,8. Mai 2020(abgerufen am 9. Mai 2020 )
Anhänge
Literaturverzeichnis
- Die blaue Obelisk-Interoperabilität in der chemischen Informatik , Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner und Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Modell. ;; 2006 ; DOI : 10.1021 / ci050400b
Zum Thema passende Artikel
- Ghemical , ein molekularmechanisches Programm, das auf OpenBabel basiert
- JOELib , Java-Version von OpenBabel / OELib
- XDrawChem , 2D-Molekularzeichnungsprogramm basierend auf OpenBabel
Externe Links
- (de) OpenBabel-Website
- (de) " Heimat des OpenBabel-Projekts " auf SourceForge.net .
- (de) E-BABEL Interaktive Version von OpenBabel, die im Virtual Computational Chemistry Laboratory gehostet wird
- ( fr ) Geoff Hutchison, einer der Hauptentwickler des Projekts, wurde im poadcast chemCast Episode 003 interviewt
- (in) Software-Design-Fehler OELib