UniProt

UniProt ist eine Datenbank von Sequenzen von Proteinen . Sein Name leitet sich aus der Kontraktion der Universal - Protein Ressource (Datenbank vereint sal von Pro - Proteinen). Es ist eine offene Datenbank, stabil und online zugänglich, sie ist das Ergebnis der Konsolidierung aller von der wissenschaftlichen Gemeinschaft produzierten Daten. UniProt ist eine kommentierte, hierarchische Datenbank, in der jede Sequenz von einem reichhaltigen Satz an Metadaten und Links zu vielen anderen Datenbanken begleitet wird: bibliografisch, phylogenetisch, Nukleotid ... Zusätzlich zur Aminosäuresequenz von Proteinen bietet UniProt Informationen zu ihrer Funktion und Struktur sowie Links zu anderen Datenbanken.

UniProt kombiniert Daten aus den Datenbanken Swiss-Prot , TrEMBL und Protein Information Resource (PIR) und wird regelmäßig aktualisiert. Seine Daten basieren unter anderem auf dem ExPASy- Server des Schweizerischen Bioinformatik-Instituts und dem des EBI . Diese Server bieten insbesondere die Suche nach homologen Sequenzen in der Datenbank mittels Sequenz-Alignment-Tools wie FASTA oder BLAST .

Hinweise und Referenzen

  1. (in) Uniprot-Konsortium , Die universelle Proteinquelle (UniProt)  " , Nucleic Acids Res. , Bd.  35, 2007, D193-7 ( PMID  17142230 , DOI  10.1093 / nar / gkl929 )

Siehe auch

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