Strukturmuster

In der Biochemie ist ein Strukturmotiv , auch Strukturmotiv geschrieben , eine dreidimensionale Anordnung von mindestens zwei Sekundärstrukturen von Biopolymeren wie Proteinen oder Nukleinsäuren , die funktionelle Bedeutung haben oder Teil einer Proteindomäne sind .

Die Strukturmotive von Proteinen bleiben häufig während der Evolution erhalten und können ein Zeichen für funktionelle Ähnlichkeiten zwischen Proteinen sein, die dasselbe Strukturmotiv teilen. Es ist jedoch nicht möglich, die biologische Funktion eines Proteins allein aufgrund seiner Strukturmotive abzuleiten, die darüber hinaus nicht immer direkt aus ihren sequentiellen Motiven ableitbar sind .

Strukturmotive, die häufig in verschiedenen Proteinen vorkommen, sind zum Beispiel:

Die sequentiellen Muster von Nukleinsäuren führen nicht notwendigerweise zu unterschiedlichen Strukturmustern: Dies kann bei bestimmten Ribonukleinsäuren mit sogenannten "  Stammschleifen  " - oder "Haarnadel" - oder " Pseudoknoten  " -Mustern der Fall sein , aber die DNA tendiert dazu behalten ihre Struktur unabhängig von ihrer Nukleotidsequenz gestrandet bei.

Anmerkungen und Referenzen

  1. (in) John Kuriyan, Die Moleküle des Lebens: Physikalische und chemische Prinzipien , Garland Science, 2012, p.  151 . ( ISBN  978-1-135-08892-7 )
  2. (in) Ruchi Singh, Bioinformatik: Genomik und Proteomik , Vikas Verlag, 2015, p.  230 . ( ISBN  978-9-325-97855-3 )
  3. (in) Florent Masseglia, Erfolge und neue Wege im Data Mining , Idea Group Inc (IGI), 2008. ( ISBN  978-1-599-04645-7 )
  4. (in) David Lee, Oliver Redfern und Christine Orengo , Vorhersage der Proteinfunktion anhand von Sequenz und Struktur  " , Nature Reviews. Molecular Cell Biology , vol.  8, n o  12, Dezember 2007, p.  995-1005 ( PMID  18037900 , DOI  10.1038 / nrm2281 , online lesen )
  5. (in) Damien Devos und Alfonso Valencia , Praktische Grenzen der Funktionsvorhersage  " , Proteins , Vol.  41, n o  1, Oktober 2000, p.  98-107 ( PMID  10944397 , DOI  10.1002 / 1097-0134 (20001001) 41: 1 <98 :: AID-PROT120> 3.0.CO; 2-S , online lesen )