Die MetaCyc- Datenbank enthält zahlreiche Informationen zum Metabolismus und zu den Enzymen vieler Lebewesen: Struktur von Enzymen, Cofaktoren, Aktivatoren und Inhibitoren, Substratspezifitäten und in einigen Fällen kinetische Konstanten. Es enthält auch Kommentare und Referenzen in der Literatur. MetaCyc sammelt hauptsächlich experimentelle Daten zu Stoffwechselwegen.
MetaCyc wird als Referenzdatensatz verwendet , um den Metabolismus von Lebewesen basierend auf der Sequenzierung ihres Genoms vorherzusagen . Dies war bei Hunderten von Organismen der Fall, einschließlich derjenigen in der BioCyc-Datenbanksammlung .