Jmol
Jmol
Streptavidin - Molekül .
| Entwickelt von | Jmol Entwicklungsteam |
|---|---|
| Letzte Version | 14.31.34 (7. März 2021) |
| Erweiterte Version | 13.1.4 (10. September 2012) |
| Anzahlung | sourceforge.net/p/jmol/code/HEAD/tree |
| Geschrieben in | Java |
| Umgebung | Plattformübergreifend |
| Formate lesen | Proteindatenbank ( en ) , Kristallographische Informationsdatei , MDL Molfile ( d ) , Chemische Markup-Sprache , vereinfachte Spezifikation und Format der Eingabe der molekularen Eingabezeile .xyz |
| Sprachen | Mehrsprachig |
| Art | Chemoinformatik |
| Lizenz | GNU Lesser General Public License |
| Webseite | jmol.sourceforge.net |
Jmol ist eine kostenlose Software zur Visualisierung chemischer Strukturen in 3D. Es wird hauptsächlich von Studenten, Professoren und Forschern der Chemie und Strukturbiologie verwendet . Es wurde in Java entwickelt und ist plattformübergreifend. Somit funktioniert es auf Windows-, Mac OS X-, Linux- und Unix-Systemen.
Eigenschaften
Die Software ist in drei Formen erhältlich:
- Eine unabhängige Anwendung;
- Ein Software-Kit zur Integration von Jmol in andere Java-Anwendungen;
- Ein Java-Applet, das in eine Webseite integriert werden kann und zahlreiche Möglichkeiten zur Visualisierung von Molekülen bietet.
Die Jmol-Software unterstützt viele Anzeigemodi:
- Ball und Stock ( Ball und Stock );
- CPK- Füllung ( Raumfüllung );
- Band ( Band );
- usw.
Darüber hinaus kann Jmol viele Dateiformate lesen, darunter Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol) und Chemical Markup Language (CML).
Das Jmol-Applet bietet eine kostenlose und plattformübergreifende Alternative zum Chime-Plugin, das nicht mehr gewartet wird. Obwohl die Jmol-Software viele Funktionen hat, die in Chime nicht verfügbar sind, zielt sie nicht darauf ab, alle Funktionen von Chime bereitzustellen (insbesondere den Sculpt- Modus ). Chime erfordert die Installation eines Plugins und von Internet Explorer 6.0 oder Firefox 2.0 mit dem Microsoft Windows-System oder von OS 9 / Netscape Communicator 4.8 mit dem Macintosh-System. Jmol erfordert die Installation von Java und funktioniert auf einer Vielzahl von Plattformen. Beispielsweise ist Jmol mit Mozilla Firefox, Internet Explorer, Opera und Google Chrome unter Microsoft Windows, Mozilla Firefox unter Linux und Safari unter Mac OS X voll funktionsfähig.
Verweise
- " https://sourceforge.net/projects/jmol/files/Jmol/Version%2014.31/Jmol%2014.31.34/ "
- Jmol-Übersetzungen
- (in) A. Herraez , Biomoleküle im Computer: Jmol to the Rescue , vol. 34, t. 4, 20067 p. ( Online-Präsentation , online lesen )
Siehe auch
Zum Thema passende Artikel
Externe Links
-
(de) Offizielle Website
- (en) Wiki