Die genetische Kartierung ist die Konstruktion einer Karte, die um ein Gen oder eine breite Basis auf der Genom- Ganzzahl lokalisiert ist . Allgemeiner ist es die Bestimmung der Position eines Ortes ( Gen oder genetischer Marker ) auf einem Chromosom als Funktion der Geschwindigkeit der genetischen Rekombination . Seine Entfernungseinheit ist das Centimorgan (cM).
Der Akt der Kartierung beinhaltet die Bestimmung der relativen Positionen von Loci (Genen oder DNA-Sequenzen) auf einem Chromosom . Verknüpfungskarten werden aus der Häufigkeit der Rekombination zwischen Loci erhalten . Die physikalischen Karten werden im Allgemeinen durch Verwendung einer In-situ- Hybridisierung von mit Metaphasenchromosomen klonierten DNA- Fragmenten oder durch Verwendung von somatischen Hybriden oder Bestrahlungshybriden erhalten.
Die erste genetische Karte wurde 1913 von Thomas Hunt Morgan und Alfred Sturtevant auf dem X-Chromosom von Drosophila erstellt . Die erste kartierte Pflanze war Mais im Jahr 1935 unter Verwendung der phänotypischen Markertechnik. Die Technik der molekularen Markierung ist viel jünger.
Da eine Karte ein Diagramm ist, das die relative Position von Loci auf einem Chromosom und die Abstände zwischen ihnen darstellt, unterscheiden wir die folgenden Kartentypen:
Die zytologischen Karten von Genen, die mit Mutationen assoziiert sind, können erstellt werden, wenn bestimmte chromosomale Mutationen eine Unterstützung haben, die durch Färbetechniken von Chromosomenstreifen nachgewiesen werden kann.
Die vergleichende Kartierung ist der Vergleich der Position von Genen und Markern auf der Chromosomenkarte zwischen Arten . In Vergleichen zwischen eng verwandten Arten finden wir ein hohes Maß an Erhaltung:
In diesem Fall kann die Position mehrerer Gene unter Verwendung eines Datenmodells vorhergesagt werden. Vergleiche zwischen phylogenetisch entfernten Arten zeigen einen Anstieg des Syntenieverlustes.
Das Mapping S1 ist ein Verfahren zur Charakterisierung von Veränderungen der RNA nach der Transkription ( Spleißen von Introns usw.) durch Hybridisierung der RNA mit einer einzelsträngigen DNA und Behandlung mit Nuklease S1.