Ein Agrarökosystem oder Agrosystem ist ein vom Menschen verändertes Ökosystem , um einen Teil der von ihm produzierten organischen Stoffe, im Allgemeinen für Lebensmittel, zu nutzen.
Dies ist Gegenstand des Studiums der Agrarökologie als wissenschaftliche Disziplin. Dabei wird es willkürlich als funktional und räumlich zusammenhängendes landwirtschaftliches Ganzes einschließlich seiner lebenden und nichtlebenden Komponenten sowie deren Wechselwirkungen definiert.